La Maestría en Sostenibilidad para el Desarrollo Regional está estructurada en tres ejes, de acuerdo al siguiente mapa curricular:
- Eje de Interculturalidad. Se cursa durante los tres primeros semestres y su contenido se orienta a comprender los procesos interculturales a partir de los principales exponentes teóricos y su importancia en el ámbito regional, nacional e internacional, pasando por una crítica a las concepciones occidentales.
- Eje disciplinar. Abarca los tres primeros semestres y comprende conocimientos teóricos y prácticos generales y específicos para las terminales. Las unidades de aprendizaje del primer semestre son de formación común, mientras que las del segundo y tercer semestre aportan elementos teóricos y prácticos para las terminales. El estudiante debe elegir la opción de su conveniencia antes de iniciar el segundo semestre, y así, las unidades de aprendizaje que curse serán específicas de la terminal elegida.
- Eje Metodológico y de Vinculación. Se cursa en cuatro semestres teniendo como elemento principal la práctica. Incluye tutoría, trabajo de investigación e intervención con la comunidad para atender problemas específicos en el ámbito de la sostenibilidad.
El mapa curricular cuenta con dos ejes verticales, que son:
- Eje de formación común. Comprende el primer semestre y permite proporcionar los fundamentos para todos los estudiantes, independientemente de la terminal que elijan.
- Eje de formación por opción terminal. Abarca del segundo al cuarto semestre. Las unidades de aprendizaje de este eje permiten lograr las competencias específicas de cada opción terminal.
Unidades de aprendizaje obligatorias por nivel de especialización durante el segundo semestre:
| Especialización | Unidades de aprendizaje | Clave |
| Restauración Ambiental | Elementos básicos de ciencia aplicados a restauración | MS-RA201 |
| Ecosistemas de México y su restauración | MS-RA201 | |
| Gestión para el desarrollo | Organización social para la gestión de la sostenibilidad | MS-GD201 |
| Diagnóstico ambiental para la gestión de la sostenibilidad | MS-GD202 |
Unidades de aprendizaje electivas por terminal durante el tercer semestre, a elegir dos de cinco:
| Especialización | Unidades de aprendizaje | Clave |
| Restauración Ambiental | Restauración de suelos | MS-RA301 |
| Conocimiento ecológico tradicional y adaptación | MS-RA302 | |
| Conservación integral de recursos: enfoque eco-geográfico | MS-RA303 | |
| Economía ecológica y sostenibilidad | MS-RA304 | |
| Temas selectos en restauración ambiental | MS-RA305 | |
| Gestión para el desarrollo | Gestión de proyectos | MS-GD301 |
| Gobernanza para la gestión y la sostenibilidad | MS-GD302 | |
| Derecho ambiental | MS-GD303 | |
| Educación ambiental | MS-GD304 | |
| Temas selectos en gestión y sostenibilidad | MS-GD305 |
En el cuarto semestre solamente se cursa la asignatura denominada Preparación de trabajo recepcional, correspondiente al eje metodológico y de vinculación comunitaria.
Al inicio del primer semestre, de manera colegiada, el Núcleo Académico Básico asigna un Comité Tutor a cada estudiante, integrado por un Director(a) y dos asesores, quienes le apoyan en su formación académica y le orientan para la óptima conclusión de sus estudios en tiempo y forma hasta su titulación. Al término de cada semestre los estudiantes presentan avances de investigación y son evaluados por su Comité tutor.
Los cursos de tercer semestre se eligen en acuerdo entre estudiante y director(a), según lo requiera su proyecto de investigación. La materia denominada Temas selectos no cuenta con un programa de contenidos puesto que es un curso que eligen aquellos estudiantes que no encuentran en el listado de las cinco electivas una opción pertinente para su proyecto de investigación. Eligen la de Temas selectos y entre estudiante y docente seleccionan cuidadosamente la temática, organizan los contenidos, establecen las formas y frecuencia de asesorías, y estipulan métodos de evaluación, tiempos y resultados. Cae precisar que todas las materias contribuyen a la formación de los estudiantes en la terminal que hayan elegido, por lo que se espera que todos esos contenidos, en general o en particular, se vean reflejados en el trabajo de titulación.
Hay cursos que se pueden tomar en otra institución educativa nacional o internacional, o con un investigador que no pertenezca al NAB, según lo determine y gestione el comité tutor en conjunto con el estudiante y con aprobación de la coordinación, y siempre que no contravenga con las temporalidades de este posgrado, de sus reglamentos y de la beca.